Atnaujinimo darbų metu taip pat nebus galimybės sveikatos priežiūros įstaigoms pateikti ar gauti duomenis iš E. sveikatos sistemos, pacientams ir sveikatos bei farmacijos specialistams prisijungti prie savo E. sveikatos sistemos paskyrų, gyventojams įsigyti medicininių paslaugų. Be to, iš portalų gpasas.lt, esveikata.lt ar kitų išdavimo vietų laikinai nebus galimybės atsisiųsti galimybių paso ar ES skaitmeninio COVID pažymėjimo.
Siekdamas, kad suplanuoti E. sveikatos sistemos atnaujinimo darbai sukeltų kuo mažiau nepatogumų, Registrų centras apie atnaujinimo darbus ir laikiną sistemos neveikimą iš anksto informavo sveikatos priežiūros įstaigų atstovus.